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Un nuevo método bioinformático detecta cambios genéticos en tumores en horas

30 Oct 2014
Un nuevo método bioinformático detecta cambios genéticos en tumores en horas

Un grupo de genómica computacional de Barcelona ha desarrollado un nuevo programa bioinformático, denominado 'SMUFIN' (por Somatic Mutations Finder), que analiza los cambios genéticos en pacientes de cáncer en pocas horas, una operación en la que hasta ahora se empleaba una semana. Su desarrollo, de libre acceso para uso académico y científico y de pago para objetivos comerciales, fue publicado ayer en la revista "Nature Biotechnology".

La creación de este programa ha necesitado de dos años de trabajos de supercomputación, en una investigación liderada por el Barcelona Supercomputing Center-Centro Nacional de Computación (BSC-CNS), en la que también han participado el Hospital Clínic, el Instituto de Investigación Biomédica August Pi i Sunyer, el European Molecular Biology Laboratory de Heidelberg, el Centro Nacional de Análisis Genómico de Barcelona y el Instituto de Oncología de la Universidad de Oviedo.

"Con él se pueden detectar las mutaciones celulares de un tumor cancerígeno en cinco horas, y además de una forma más sencilla y más barata", declaró a Efe el biólogo David Torrents, que ha liderado la investigación.

El programa permite la detección, de forma "sencilla, rápida y precisa", las alteraciones genéticas que causan la aparición y progresión de tumores "e incluso es capaz de localizar las grandes reorganizaciones de cromosomas difícilmente detectables hasta ahora", explicó Torrents.

El biólogo, experto también en informática, ve en esta nueva herramienta un paso fundamental para alcanzar la "medicina personalizada, ya que el análisis genómico de cada paciente ayudará a su diagnóstico y permitirá la selección de tratamientos cada vez más eficaces y menos agresivos".

Torrens explicó que para estudiar un cáncer "hay que identificar la mutación de la célula que se ha vuelto loca y para eso se mira en el genoma qué mutación ha sufrido. Se secuencia el genoma y se compara con una célula sana, para ver qué cambio hay y qué proteína está tocada y ver qué fármaco se tiene que dar".

Fuente: Faro de Vigo