Científicos del Instituto Genómico A*STAR de Singapur (A*STAR GIS) han desarrollado un nuevo método basado en la inteligencia artificial (IA) denominado «Fragle» que facilita y agiliza el seguimiento del cáncer mediante análisis de sangre.

Este método, que solo requiere una pequeña muestra de sangre, analiza el tamaño de los fragmentos de ADN en la sangre para revelar patrones distintivos que diferencian el ADN canceroso del ADN sano, lo que ayuda a los médicos a realizar un seguimiento más preciso y frecuente de la respuesta al tratamiento del cáncer.

La investigación se publicó en Nature Biomedical Engineering en marzo de 2025.

Los métodos existentes para medir el ADN canceroso en la sangre, también conocido como ADN tumoral circulante (ctDNA), suelen requerir una secuenciación del ADN compleja y costosa para detectar mutaciones cancerosas comunes.

Sin embargo, dado que las mutaciones cancerosas varían entre los pacientes, los resultados de las pruebas pueden ser inconsistentes, lo que dificulta a los médicos el seguimiento eficaz de la respuesta al tratamiento del cáncer mediante análisis de sangre.

Fragle utiliza la IA para analizar el tamaño de los fragmentos de ADN en la sangre.

El ADN canceroso tiende a presentar patrones de tamaño diferentes en comparación con el ADN sano, y el modelo de IA de Fragle puede identificar estas diferencias utilizando cantidades muy pequeñas de ADN.

Como resultado, el método permite un seguimiento del cáncer más rápido y asequible.

También ha demostrado una alta fiabilidad, ya que ofrece resultados precisos en muestras de sangre de cientos de pacientes con cáncer y distintos tipos de cáncer.

Además, el método es versátil y compatible con la mayoría de las técnicas de perfilado de ADN que se utilizan habitualmente en los hospitales o que ofrecen los proveedores comerciales.

Ventajas principales de Fragle:

Más rápido y más barato: Fragle ofrece una forma más rápida y potencialmente más asequible de controlar el cáncer mediante análisis de sangre, ya que solo requiere una pequeña cantidad de ADN. Las pruebas comerciales convencionales pueden costar más de 1000 dólares singapurenses, mientras que el coste estimado de Fragle es inferior a 50 dólares singapurenses.

Versátil: Fragle funciona con métodos de perfilado de ADN ampliamente utilizados en hospitales y laboratorios comerciales, lo que permite su fácil y rápida adopción en los flujos de trabajo existentes.

Detecta los primeros signos de recaída: Fragle puede identificar pequeños rastros de cáncer que quedan después de la cirugía y el tratamiento (conocidos como enfermedad residual mínima o MRD), lo que ayuda a los médicos a detectar posibles recaídas de forma temprana.

«Al igual que los científicos rastrearon los brotes de COVID-19 detectando partículas virales en las aguas residuales, Fragle analiza fragmentos de ADN en la sangre para monitorizar la respuesta al tratamiento del cáncer y detectar recaídas de forma precoz», explica el Dr. Anders Skanderup, científico principal sénior del Laboratorio de Genómica Computacional del Cáncer de A*STAR GIS y autor principal de esta investigación.

«Aunque los métodos existentes tienen sus puntos fuertes, a menudo son complejos y caros. Queríamos desarrollar un enfoque más sencillo, asequible y accesible, que permitiera un seguimiento preciso sin añadir carga al flujo de trabajo clínico». «

El equipo también está estudiando cómo mejorar la sensibilidad de Fragle para detectar niveles aún más bajos de ADN canceroso, lo cual es fundamental para la detección precoz de la recaída de la enfermedad en pacientes con cáncer.

Para aplicar estos hallazgos, el equipo también está colaborando con el Centro Nacional del Cáncer de Singapur (NCCS) para identificar oportunidades y aplicaciones clínicas.

De cara al futuro, el equipo tiene previsto explorar cómo se puede implementar Fragle en los hospitales locales para mejorar la atención a los pacientes con cáncer.

El profesor asociado Daniel Tan, consultor sénior de la División de Oncología Médica del Centro Nacional del Cáncer de Singapur y coautor del estudio, afirma: «Estamos muy ilusionados por iniciar estudios sobre cómo métodos como Fragle pueden detectar antes la recaída de la enfermedad en pacientes locales con cáncer de pulmón».

En un estudio en curso con más de 100 pacientes de ensayos clínicos, el equipo del GIS-NCCS está utilizando Fragle para monitorizar los niveles de ctDNA cada dos meses durante el tratamiento, con el objetivo de detectar signos de recaída antes de que aparezcan en las exploraciones rutinarias.

El equipo también está estudiando si los cambios tempranos en el ctDNA pueden identificar qué pacientes son propensos a tener una respuesta favorable o desfavorable al tratamiento.

El objetivo del estudio es evaluar el valor de incorporar las pruebas de ADNct en el seguimiento rutinario de los pacientes con cáncer durante el tratamiento.

El Dr. Wan Yue, director ejecutivo de A*STAR GIS, afirma: «Estamos muy entusiasmados con el potencial que ofrece Fragle para ayudar a nuestros profesionales sanitarios a detectar y seguir el cáncer con mayor precisión y supervisar los tratamientos de forma más eficaz, lo que se traducirá en una mejor atención oncológica para los pacientes. Esperamos que nuestra investigación genómica se traduzca en beneficios para la salud de la población, no solo en Singapur, sino en todo el mundo».

Fuente: Agencia para la Ciencia, la Tecnología y la Investigación (A*STAR), Singapur