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De los 37 billones de células en el cuerpo humano, la capacidad de distinguir un tipo de célula de otra no es tan simple como se podría pensar.
Los científicos de OHSU han desarrollado por primera vez un método para reconocer rápida y eficientemente los subtipos de células dentro del cuerpo.
Dirigido por investigadores en el laboratorio de Andrew Adey, Ph.D., el descubrimiento mejorará la comprensión de la enfermedad a nivel molecular.
Esta nueva tecnología en última instancia podría permitir el desarrollo de tratamientos precisos de enfermedades como el cáncer, trastornos que destruyen las neuronas en el cerebro y enfermedades que afectan el corazón y los vasos sanguíneos.
Los hallazgos se publican en la revista Nature Biotechnology.
La nueva tecnología proporciona un método para escalar un método previamente conocido para perfilar tipos de células distinguidas por el patrón de marcadores químicos que adornan su ADN.
"Será increíblemente valioso en cualquier entorno donde haya heterogeneidad de tipo celular", dijo Adey, autor principal, profesor asistente de genética molecular y médica en la Escuela de Medicina OHSU y miembro del Instituto Cardiovascular Knight. "Las principales áreas de interés serán el cáncer y la neurociencia, pero también lo aplicamos a las enfermedades cardiovasculares".
Todas las células tienen el mismo genoma, el conjunto completo de genes codificados dentro de la célula.
El patrón de qué genes se expresan en una célula determinada es lo que distingue a una neurona de, por ejemplo, una célula hepática.
Incluso entonces, resulta que hay distinciones entre celulas similares.
En 2017, los científicos demostraron una forma de discernir los subtipos de neuronas midiendo los marcadores químicos entre ellos: el patrón de grupos metilo conectados a su ADN, conocido como su metiloma.
La nueva investigación de Adey y sus coautores desarrolla un método para perfilar el metiloma de grandes cantidades de células individuales a la vez agregando combinaciones de secuencias de ADN únicas, o índices, a cada célula que son leídas por un instrumento de secuenciación.
Los científicos utilizaron el nuevo método de indexación en varias líneas celulares humanas y en el cerebro de un ratón para revelar el metiloma de 3.282 células individuales.
Eso es aproximadamente un aumento de 40 veces en el rendimiento del método existente de secuenciación de células individuales.
"Podemos perfilar miles de células simultáneamente", dijo Adey. "Esta tecnología reduce el costo de preparar bibliotecas de metilación de ADN de células individuales a menos de 50 centavos por celda, desde $ 20 a $ 50 por célula".
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